【水下能见度低】
长江水比较浑浊，再加上连日暴雨，加重了水的浑浊度，潜水员在水下的能见度低，视距短。一次下水要待１个小时左右，目前，潜水员基本靠手来探查，虽然有强光手电筒，但在浑浊的水下什么也看不见，给摸排带来很大难度。
【水速快】
正常情况下，流速超过１．５米／秒，按照潜水规定就不能实施潜水。但现场实测显示，暴雨之后，长江流速加快，除靠近岸边的一侧流速相对较慢外，沉船区域部分位置水流速度高达１．８米／秒。救人是第一要务，虽然危险，潜水员仍然冒险下潜。
【水温寒冷】
和地震等岸上发生的灾难性事件不同，虽然进入初夏，水温在２０摄氏度左右，但潜水员长时间在水中停留，身体仍会感觉寒冷。不适感增加后，将直接影响救援效率。
【被救人员情绪失控】
由于长期被困在黑暗、寒冷的水中，不少幸存者身心受损，基本处于心理崩溃边缘，在见到潜水员后会出现死死抱住潜水员、对正确救援指令接受度较低等情况。潜水员在找到生还者之后，要和被救者做简单的沟通，还要指导救援者正确佩戴潜水装具、获得正常呼吸，更重要的是，还要确保顺利通过狭窄通道，把生还者带出。
【水下环境复杂，曲线进出危险大】
因救援需要，潜水员必须深入船体，其携带的管子、绑在身上的信号绳等非常容易被沉船内的门板、机器等杂物缠绕，一旦锋利的杂物损害救援设备，会对潜水员的生命造成巨大威胁。
